草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿程序最易见的妇科疾病其一。肾阻止中CaOx硫化锌过过剩建成沉积会出现肾小管生殖细胞挫裂伤和凋亡，最后出现肾结石的建成。短链肌肉酸由胃肠子内活性污泥病毒进行发酵饮食营养人造纤维诞生，不只在部分区域胃肠子天然屏障中利用效应，又很在程序级别上也利用主要效应。在当中，丁酸是最极为丰富的短链肌肉酸，存在免疫细胞克制和免疫细胞克制效应,本研究分析研究丁酸对CaOx肾结石的效应还有其暗藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医疗泌尿急诊科吴忠教学、周子健硕士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠院士、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物工程与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网洛药理学学服务的，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

散文品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客院校：华山医疗 科研关键字：大鼠、HK-2生殖细胞 分成小组讯息：对比组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提供了高技术：手机网络药剂学学检侧

工作思路的程序流程图

分析结杲

分析员工先是建立大鼠沙盘绘图，顺利通过生活生物化学公式和组织开展病理学学刺绣等分析策略发觉丁酸能以减少CaOx沙盘绘图大鼠肾CaOx纳米线的形成了和受损，优化CaOx沙盘绘图大鼠的真菌感染受损和硫化类物质的太过展示。除此以外，丁酸还可以抑制作用草酸分析的HK-2癌细胞核受损、硫化应激性和癌细胞核凋亡。 为钻研丁酸设计和靶什么是表观遗传遗传手机无线在线，钻研的人员从PubChem想要高效率的获取到丁酸和丁酸酯的二维和三维图设计（图1A）。能够PharmMapper动态db2统计资料资料库和Uniprot动态db2统计资料资料库整理后共筛分出115个丁酸靶什么是表观遗传遗传供进这一步浅析。将什么是表观遗传遗传下拉列表拷贝到STRING动态db2统计资料资料库，确定PPI手机无线在线浅析。Cytoscape根据了排列顺序的前20的核心靶什么是表观遗传遗传的简略手机无线在线图，包涵CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。以下核心什么是表观遗传遗传与手机无线在线中的某个什么是表观遗传遗传均现象出一些 的涉及到的性，发现以下什么是表观遗传遗传很有可能性充分利用着融合做用。GO和KEGG浅析揭露了丁酸核心什么是表观遗传遗传的涉及到的方式和生物制品工程学用途（图1C）。核心什么是表观遗传遗传其主要的与类固醇刺激目的素药回话、硫化应激状态表现回话、抗逆性氧受损细胞对类固醇刺激目的素药刺激目的的表现或者对酸碱性生物制品学材料的表现有关的信息。由此可见经验，以下核心什么是表观遗传遗传其主要的进入了硫化应激状态表现和对抗逆性氧的生物制品工程表现阶段，是肾结石形成了制度化中至关最重点的方式，这发现丁酸很有可能性在肾结石中充分利用最重点做用。

图1| 丁酸形式与靶基因组网格研究(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进几步思考丁酸对CaOx肾结石实际上切靶dna，的理论调查实现分析工人应用GEO数剧库对GSE73680中良好相较比较与CaOx肾结石患病者的dna地域差异实行了的理论调查实现分析。相较比较组与CaOx结石患病者的差异性性地域差异表答dna（DEGs）筛分规范为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个dna发生的差异性变幻，在这当中3379个（89.4%）dna表答调整，404个（10.6%）dna表答再降（图2A）。对DEGs实行聚类分析法实现分析法实现分析，热图提示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析法实现分析法的特点（图2B）。随即，的理论调查实现分析工人利用GeneCards数剧库工人司法鉴定了370个有机会与CaOx肾结石重要性联的dna，排名第一前20位的推测dna非常重要性联性评定如2C如下。考虑到获得丁酸根治CaOx肾结石的重中之重靶点，的理论调查实现分析工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性联dna整理获得好几回个Venn图。最中，CYP2C9被判定为丁酸直接影响CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。还有就是，的理论调查实现分析工人还实行了丁酸与CYP2C9的氧分子连通，CYP2C9的六个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互不用处，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利于网站药剂学学預测CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶表观遗传后，学习工作员还进行神经细胞系实验英文可确认了CYP2C9可影响草酸诱发的HK-2神经细胞系的ROS水准、支原体感染板材损害和凋亡。

图2| 绝对多数据库联手进行分析估计CYP2C9是丁酸角色于CaOx肾结石的靶人类基因

实验数据

本探析应先察觉到了丁酸在离体和内部均能促使CaOx肾结石沙盘模型的被氧化反应应激反应状态和细菌感染损害，很快借助网上药学学需求赢得丁酸决定CaOx肾结石的未知靶点——CYP2C9，最后一步借助生殖细胞系实验室声明CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2生殖细胞系ROS系统、细菌感染损害和凋亡。那些察觉到了证明丁酸将会借助促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的被氧化反应应激反应状态，减弱细菌感染损害。一种整个过程中拜谱生物制品学带来了网上药学学系统业务性，凡此种种拜谱生物制品学可加快熟透健全的基因遗传组学、蛋清质组学、分解组学等两组学食品及系统业务性，欢迎会呼叫详询！ 参照专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.