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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已提示出范围广的生物技术可溶性，具有抗良性肿瘤和抗病力毒用。平常，三萜是能够甲羟戊酸行业合出的，并从天然水作物和念珠菌中领取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊登了发表文章“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的科研文章。该科研察觉三萜类有机物野生灵芝粉酸（GA）是能够液滴教育培养的无柄野生灵芝粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的怪物应用引起的。能够转录组和血清质组学新技術进一次探索性无柄虫草菌丝体中DHT引起几种虫草酸（GA）的规则，并基于两组学新技術判断到的性别性别差异什么是基因和性别性别差异血清，猜测DHT 怪物获得 GA 的路线。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录混合物析和能力区分

凭借对无柄灵芝粉念珠菌菌丝体来进行转录组测序共取到67230个转录本和14297个单DNA。在这个单DNA中，495个被鉴定会为一定的差异表现DNA（DEGs），在这当中213个表现上浮，279个表现再降（图1A）。GO生物学丰度数据讲解后，DEGs为生物学具体步骤（BP）、组织有效成分（CC）和氧分子性能（MF）3类。在BP类属中，出現了前六个子类属：抗菌药吸附新陈分泌具体步骤，醋酸钠盐新陈分泌具体步骤和甲酸盐新陈分泌具体步骤;而在CC类属中，组织外区、突触和好体、突触构成是前六个亚类。这对于MF类属，甲酸脱氢酶（NAD）灵抗逆性、腐蚀修复酶灵抗逆性和酸氨（或酰胺）连接方式酶灵抗逆性是前六个亚类属（图1B）。在DEGs的KEGG移动信号径路数据讲解中，前30条生物学丰度度更高的移动信号径路有27条包括新陈分泌，在这当中二氧化氮新陈分泌、乙醛酸盐和二羧酸盐新陈分泌、丙酸盐新陈分泌移动信号移动信号径路差异性生物学丰度（图1D）。

图1|转录成分析和技能细分

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

经过对无柄野生灵芝真菌孢子菌丝体参与者球球球血清酶质组学分享，共有确立了16,457种独一无二肽、2606种球球球血清酶质和2588种参考值球球球血清酶质。在阀值|FC|>1.2和p<0.05的淘汰前提条件下，这里2606种球球球血清酶质中，94种被技术鉴定为性别地域差异形容球球球血清酶（DEPs），至少52种调涨，42种变动（图2A），图2C显现了性别地域差异形容球球球血清酶的聚类了解法分享热图。从GO分享来讲，BP专业类别显现，一般数DEPs参与者冰醋酸盐可可分解分泌操作流程、消炎药可可分解可可分解分泌操作流程和药物剂量可可分解可可分解分泌操作流程。CC类DEPs在神经元外区、过脱色反应物酶体和微体中总量上限，脱色反应保存酶菌物酶和甲酸脱氢酶（NAD）菌物酶在MF类中DEPs的此例上限（图2B）。与转录组结杲差不多，KEGG大数据信息通道分享显现，成千上万DEPs在可可分解分泌中菌物聚集，至少3条最菌物聚集的手段是光合菌物中的碳确定、碳可可分解分泌和MAPK大数据信息大数据信息通道（图2D）。前者，经过分享GO大数据库显示的CC对DEPs参与者亚神经元标记分享和标注（图2E），DEPs最重点分布图在神经元质（40.66%）、神经元膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），方法论上是GAs菌物结合的最重点具体位置。

图2|淀粉酶质组的按量了解和用途认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

为业物生成和相较比较组侯选DEGs和DEPs生产制作了维恩图，有20个差别的展现染色体（图3A）。对转录组和血清质组中E组和C组共同拥有的DEGs/DEPs通过聚类算法介绍，发展mRNA和血清质期间有15-7个上浮染色体和5-7个变动染色体，DEGs两者当地翻译的DEPs展现含量呈正一些，因为Pearson的一些因子介绍，在转录组和血清质组期间测试到相对应较高的一些性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）查重最终体现，E组和C组1一个DEGs的表述层次文化差异显著性，之中9个为上浮DEGs，8个为下降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的表述动向与转录酚类化合物析最终保持一致。

图3|蛋清质组的参考值介绍和功能键印证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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