
近日,深圳医科高校独一附设青岛博士整形医院医院王学浩院士评选专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶点消耗的能量分解检测分析服务。
英文怎么说版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名主题词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
加盟商企业:南京医科大学
深入分析产品:细胞
拜谱提高服务于:转录组测序+蛋清互作组+靶向药物精力新陈代谢组
系统行车路线:
调查然而
01、YBX1被亲子鉴定为HCC中糖酵解的首要人类基因
本探讨采集工具HCC癌症样品(n=7)的单癌症神经元RNA测序数据信息统计集实施探讨,知道糖酵解特异性通常一起在癌症癌症神经元中,hdWGCNA探讨判别出9个DNA模快(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的能探讨来确定YBX1为经济独立能风险性影响(图1H)。进一次组合IHC、WB实验报告和癌症聚集化与相临非癌症聚集化的的空间转录组学数据信息统计集确认YBX1是肝癌症神经元癌医疗的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确立为调高HCC生殖细胞糖酵解的关健缘由
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能量是什么分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1紧密结合并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合在一起并带动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷碱化,然而促使其核转位
进三步检验YBX1的O-GlcNAc糖基化有没有影向其磷碱化,在OGT敲低的HCC组织中或用OGT能够抑药物制剂OSMI-1处置,YBX1核蛋白酶质标准不错消减,YBX1磷碱化不错减低(图4A-C)。IP工作出现,在差不多的Flag-YBX1底物标准下,YBX1-WT的磷碱化标准不错大于YBX1-T57A,表面磷碱化的增添不单仅是鉴于比较高的YBX1核蛋白酶质形容(图4D)。溶合了核和质类物质看见TMG处置的HCC组织中YBX1核形容的增大(图4E-F),进三步看见YBX1磷碱化的重要的自动调节细胞因子是AKT(图4G-I)。等等看见注重O-GlcNAc糖基化经过利于其磷碱化来增強YBX1核蛋白酶质保持稳确定并利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖不助进其进步骤突发磷过酸遮盖并也可以推动其核转位
05、YBX1促进会PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1增强PKM2转录
06、YBX1 能升高组蛋清乳碱化表达平行
探析看见YBX1敲低重要变低蛋清质乳过酸,针对是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解调节剂2-DG的实验报告验证了糖酵解与组蛋清乳过酸的直观的锁定,调节糖酵解可重要变低H3K18la关卡(图6D)。PKM2过展现可逆性转YBX1敲低引致的H3K18la越来越低,以外源乳酸处里一方面提高H3K18la,还持续性YBX1展现上浮,提示信息长期存在顺向评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la利用丰度于YBX1进行子直观的有助于其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并看见P300 上浮是YBX1减弱H3K18乳酰化成用的考核机制(图6K-L)。
图6.YBX1增強H3K18乳过酸装饰级别
新闻稿件个人心得体会
在这个研究分析中报导了YBX1在HCC中高体现,而且与糖酵解密码切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,而使可靠营养物质质并加大其体现。各种装饰还推动YBX1在T57处的磷酸性反应,推动其核易位。之所以,相应阶段怎强了糖酵解涉及到的基因组组的转录并刺激作用乳酸的产生了。除此以外,YBX1激话P300的转录,因而驱程组营养物质的乳酸性反应,有点是H3K18la,H3K18乳酸性反应正向着调空YBX1基因组组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传双面馈环体系图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶点能量场排泄组技术服务,拜谱怪物建立了完善成熟的转录组学、血清组学、汉语翻译后遮盖组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
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Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.